Respondiendo a mi propia pregunta:
El error fue con Hibernate Envers con 3.6 que en algunos casos se metió en problemas con los nombres de los paquetes derivados de los nombres de dominio Estonia (por ejemplo, ee.codeto.foo). Esto aumentó debido al hecho de que hibernado Envers en algún momento durante la construcción de consulta utilizada "EE" como alias y en caso de que se usara los nombres de clase completa con paquetes (ahora siempre), luego hibernó que la siguiente parte en el nombre del paquete después de "EE "es un nombre de columna.
En versiones posteriores de Hibernate se resuelve este problema. Probablemente no porque esto sea de los nombres de dominio estonio, sino por un mejor uso de alias. "EE_"se usa en lugar de" ee ". Por lo tanto, cuando puede tener tan mala suerte de tener un paquete con" ee_ "Como la primera parte del nombre del paquete y se usa hibernado y usa una mapeo de muchos a muchos y tiene el caso desafortunado que Hibernet intenta usar los nombres de clase completa con paquetes, entonces existe esta menor oportunidad que puede ser infligido por este error.